基于CGR的DNA序列的时间序列模型

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：kfc1206

【摘要】

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利用DNA序列的混沌游戏表示（chaos game representation,CGR）,提出了将2维DNA图谱转化成相应的类谱格式的方法. 该方法不仅提供了一个较好的视觉表示,而且可将DNA序列转化成一

【作者】

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高洁蒋丽丽徐振源

【机构】

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江南大学理学院,江南大学信息工程学院

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

：

2010年2期

【关键词】

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时间序列模型混沌游戏表示(CGR) DNA序列长记忆 ARFIMA(p d q)模型 time series model Chaos game repres

【基金项目】

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基金项目：国家自然科学基金（No60575038）,江南大学自然科学基金（No20070365）,江南大学创新团队发展计划资助.Acknowledgements We wish to thank the referees for their insightful comments which greatly contributed to the clarity of this paper. Thi

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利用DNA序列的混沌游戏表示（chaos game representation,CGR）,提出了将2维DNA图谱转化成相应的类谱格式的方法. 该方法不仅提供了一个较好的视觉表示,而且可将DNA序列转化成一个时间序列.利用CGR坐标将DNA序列转化成CGR弧度序列,并引入长记忆ARFIMA（p,d,q）模型去拟合此类序列,发现此类序列中有显著的长相关性且拟合度很好.

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