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本研究时云南及马来西亚的37个东方蜜蜂样本进行随机扩增多态DNA分析，从20个引物中筛选出11个引物，其中9个引物扩增出多态带。共检测到66条扩增片段，其中56条为多态带。用UPGMA聚类方法构建的分子系统树显示，云南的样本、马来西亚的样本各自分别聚在一起，说明两个样本间遗传差异较大，群体之间存在着遗传分化。但就云南的32个个体而言，虽然聚类图中大多数采自同一地区的样本聚在一起，但也存在一定交叉，提示云南地理群体间近期可能存在一定的基因流。