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东北农业大学动物科学技术学院前身是始建于1948年11月的东北农学院畜牧兽医系畜牧专业。1950年2月畜牧专业独立建系,成立畜牧系,是当时全国较早成立的畜牧系之一。1993年3月畜牧系改称动物科学系。1997年10月动物科学系与东北农业大学动物营养研究所合并成立东北农业大学动物科学技术学院。