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对南瓜属4个栽培种中的11个品种进行种子蛋白质含量及碱溶蛋白SDS-PAGE分析,结果显示。蛋白质含量在4栽培种间呈现一定的差异。在种内品种间则比较接近;非还原与还原条件下,4栽培种间蛋白谱带均有差异。可将各栽培种区别开。其中以还原条件下区别更为明显,栽培品种日本南瓜同时显示出中国南瓜和印度南瓜的特征条带。推测可能是2个种的种间杂交种。