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运用可根据研究对象的潜在属性内生分组的潜类别随机前沿模型，采用1999-2012年中国各省区数据，研究各省区的创新效率及影响因素。结果表明：以人力资本水平和基础设施状况为条件变量，将全国各省区分成两个技术类别，分别有各自的技术前沿和函数形式，A类别中上海市的创新效率最高，B类别中河北省的创新效率最高；平均来看，各类的创新效率均呈上升趋势，贸易开放、产业结构和金融发展对创新效率均有显著的正向作用，同时创新效率在各类内部均存在俱乐部收敛。