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【目的】对不同温度下福氏志贺菌（ Shigella flexneri ）及其分泌的膜囊泡进行比较蛋白质组学分析，为进一步理解福氏志贺菌膜囊泡的生物学活性奠定基础。【方法】采用差速离心和密度梯度离心方法，分别富集纯化37℃和30℃培养条件下的野生型福氏志贺菌2a301株和相应的膜囊泡；借助二维纳升液相色谱一线性离子阱质谱联用系统：对制备得到的4种组分蛋白进行鸟枪蛋白质组学鉴定分析。【结果】37℃和30℃培养条件下，福氏志贺菌茵体蛋白和膜囊泡蛋白的鉴定总数分别为1510、231、1412、281，4种组分的共