【摘 要】
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为评价nrDNA ITS序列对榧树属(Torreya)植物的鉴定能力,本研究利用ITS序列和4种不同的分析方法(BLAST比对,K2P遗传距离,SNP位点分析及邻近NJ树)对榧树属植物进行物种鉴定,建立系统进化树讨论其亲缘关系。结果显示,48条ITS序列长度为1095~1105 bp,种内平均遗传距离为0.0016,种间平均遗传距离为0.0150。在物种水平,BLAST比对和NJ树对榧树属植物鉴定效率最高,SNP位点分析可有效鉴定香榧和榧树。亲缘关系分析显示,榧树属其他各种均呈单系分支,但云南榧树与巴山榧
【机 构】
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重庆市药物种植研究所,重庆市渝北区经济作物技术推广站,云阳县赛凤农业开发有限公司
【基金项目】
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重庆市基本科研业务费项目(19KF10-2012)资助。
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为评价nrDNA ITS序列对榧树属(Torreya)植物的鉴定能力,本研究利用ITS序列和4种不同的分析方法(BLAST比对,K2P遗传距离,SNP位点分析及邻近NJ树)对榧树属植物进行物种鉴定,建立系统进化树讨论其亲缘关系。结果显示,48条ITS序列长度为1095~1105 bp,种内平均遗传距离为0.0016,种间平均遗传距离为0.0150。在物种水平,BLAST比对和NJ树对榧树属植物鉴定效率最高,SNP位点分析可有效鉴定香榧和榧树。亲缘关系分析显示,榧树属其他各种均呈单系分支,但云南榧树与巴山榧
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