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目的探讨肛门括约肌间瘘管结扎术治疗复杂性肛瘘的效果。方法选择本院2015年12月~2016年12月收治的90例复杂性肛瘘患者,将患者随机分为对照组与观察组,对照组采取切开挂线术治疗,观察组采取肛门括约肌间瘘管结扎术治疗,比较两组患者的临床指标及治疗效果。结果观察组患者的手术时间、住院时间、愈合时间均短于对照组(P〈0.05)。观察组患者治疗总有效率明显高于对照组(P〈0.05)。结论复杂性肛瘘患者被采取肛门括约肌间瘘管结扎术治疗,能够有效缩短手术时间,加快愈合时间,具有较好的临床效果,值得应用。