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云南共有轮藻植物5属48种。在种类组成中,丽藻属最多,轮藻属次之,其它3属的种类较少,分布特点具有热带,亚热带性质,区系属于印度-马来西亚,但鸟巢藻属、拟丽藻属、松藻属的地理分布带有地中海沿岸区系的成分。云南轮藻某些种类在形态上存在的差异显示了系统发育的间断性,同时,它们在形态上所具有的一些共同点,反映了在其进化过程中的连续性。