【摘 要】
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并系同源（paralog）和直系同源（ortholog）是物种进化过程中产生的两种基本的同源序列类型。目前判断ortholog的方法已经基本确立，而paralog的判断却还没有统一的标准。番茄全基因组
【机 构】
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中国科学院武汉植物园,中国科学院研究生院
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(30570172);中国科学院“百人计划”项目;武汉市晨光计划(20045006071-34)
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并系同源（paralog）和直系同源（ortholog）是物种进化过程中产生的两种基本的同源序列类型。目前判断ortholog的方法已经基本确立，而paralog的判断却还没有统一的标准。番茄全基因组测序正在进行中，利用Gen—Bank中已有的番茄BAC序列进行一系列不同参数下的比对（blastn），根据比对结果确定了paralog预测的最佳参数，分别是E值为10^-40，匹配序列长度为200bp，序列一致率为80％。这些参数值的确定为以后在番茄BAC序列中进行paralog预测提供了适用的参数。
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