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为了应用AFLP分子标记对菠萝种资源进行种质鉴定、分类及亲缘关系等方面的研究。最重要的是要获得高质量的DNA，菠萝叶片革质化程度较高，且纤维、多糖、多酚等次生代谢物质含量较多，严重干扰DNA的抽提或影响其后的AFLP双酶切及其扩增反应，本研究以菠萝叶片为材料，利用改良CTAB法得到了39个高质量的菠萝分类群的DNA基因组，并进行了AFLP分析，得到了条带清晰、多态性好的菠萝品种指纹图谱，这为菠萝基因库的建立、优良品种选育以及亲缘关系的系列研究提供理论依据。