【摘 要】
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目的:基于分子对接技术及分子动力学模拟预测青黛主要有效成分靛蓝、靛玉红与2019-nCoV/ACE2复合物的结合模式,推测青黛对新型冠状病毒肺炎的干预作用.方法:从蛋白晶体结构数
【机 构】
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湖北中医药大学,湖北武汉430061;湖北中医药大学,湖北武汉430061;湖北省中医院,湖北武汉430061
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目的:基于分子对接技术及分子动力学模拟预测青黛主要有效成分靛蓝、靛玉红与2019-nCoV/ACE2复合物的结合模式,推测青黛对新型冠状病毒肺炎的干预作用.方法:从蛋白晶体结构数据库、中医药资料库获取受体晶体结构、配体小分子2D结构.采用Autodock Vina1.1.2程序进行分子对接,初步分析结合情况,并获得最佳构象.应用AmberTools 18.0软件进行分子动力学模拟,完成自由能计算、氢键分析等,进一步验证结合模式.结果:数据结果显示靛蓝、靛玉红能与2019-n CoV/ACE2复合物结合,且两个体系具有相似的结合模式.结论:预测青黛可通过干预2019-nCoV/ACE2复合物对新型冠状病毒肺炎起治疗作用.
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