【摘 要】
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为挖掘可能参与烟草花序发育和抗逆胁迫相关的花序分生组织类受体激酶(Inflorescence meristem receptor-like kinase,IMK)基因家族成员,利用生物信息学方法在普通烟草基因组中鉴定出6个IMK基因家族成员,不同成员间的氨基酸序列一致性在61％～97％之间.系统进化树分析显示烟草IMKs主要分为2类,主要区别在于重复motif 12(GSIP motif)的个数差异.跨膜结构域分析显示,2种类型烟草IMKs跨膜结构域分布间存在差异,暗示这2类IMKs可能出现了功能分化.翻
【机 构】
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中国烟草总公司郑州烟草研究院,郑州高新技术产业开发区枫杨街2号 450001
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为挖掘可能参与烟草花序发育和抗逆胁迫相关的花序分生组织类受体激酶(Inflorescence meristem receptor-like kinase,IMK)基因家族成员,利用生物信息学方法在普通烟草基因组中鉴定出6个IMK基因家族成员,不同成员间的氨基酸序列一致性在61％～97％之间.系统进化树分析显示烟草IMKs主要分为2类,主要区别在于重复motif 12(GSIP motif)的个数差异.跨膜结构域分析显示,2种类型烟草IMKs跨膜结构域分布间存在差异,暗示这2类IMKs可能出现了功能分化.翻译后修饰位点分析结果表明,在拟南芥中鉴定到的IMK2的11个修饰位点,其中只有2个位点在所有烟草IMKs蛋白中均保守,推断这2个位点可能在IMKs蛋白功能发挥的过程中起着重要作用.表达分析表明,大部分IMKs在侧根和花蕾中高表达,而且被GA、IAA等激素诱导上调表达,暗示IMKs蛋白可能参与侧根和花的发育过程,同时也参与GA和IAA介导的调控反应.
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