【摘 要】
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目的 明确一起急性胃肠炎聚集性疫情中的诺如病毒的基因型别,并对其遗传进化和分子病原学特征进行分析研究.方法 采集成都市2020-08某培训机构发生的一起急性胃肠炎聚集性疫情中的病例师生和无症状从业人员肛拭子样本12份,采用实时荧光定量PCR检测.结果 为阳性的样本采用常规RT-PCR扩增RdRp区和VP1区并测序,与国内外参考株进行序列比对/和构建进化树等基因特征分析.结果 序列比对和进化树分析结果显示:此次疫情中检出的同型诺如病毒核苷酸一致性均在96.9％以上.检出的3个基因型为GI.Pa-GI.3、G
【机 构】
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成都市成华区疾病预防控制中心,成都610051
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目的 明确一起急性胃肠炎聚集性疫情中的诺如病毒的基因型别,并对其遗传进化和分子病原学特征进行分析研究.方法 采集成都市2020-08某培训机构发生的一起急性胃肠炎聚集性疫情中的病例师生和无症状从业人员肛拭子样本12份,采用实时荧光定量PCR检测.结果 为阳性的样本采用常规RT-PCR扩增RdRp区和VP1区并测序,与国内外参考株进行序列比对/和构建进化树等基因特征分析.结果 序列比对和进化树分析结果显示:此次疫情中检出的同型诺如病毒核苷酸一致性均在96.9％以上.检出的3个基因型为GI.Pa-GI.3、GI.Pd-GI.3和GII.P16-.GII.2,其RdRp区基因型均与VP1区不同.结合SimPlot等进行分析,均为重组毒株,定位在ORF1/2交叠区.结论 本起急性胃肠炎疫情是由3株重组诺如病毒引起的,成都市流行的诺如病毒基因型别增多、重组加剧;须加强诺如病毒分子流行病学监测,提升对变异、重组毒株的预警和防控能力.
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