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黄缘闭壳龟消化管总长度为背甲长的3．5～4．2倍。食管和胃壁厚，扩展性强，内壁有数条纵行皱襞。小肠较长，约占消化管总长度的60．9％，无盲肠，肠内壁有大小不一的纵行皱襞。肝较大，为体重的4．8％左右。胰脏长条形，沿十二指肠分布。气管和支气管均由呈“0”形完全闭合的软骨环和环问韧带所构成。气管较长，有45～55个软骨环；支气管较短，有30～40个软骨环。肺长囊形，蜂窝状，紧贴在背甲的内表面，从肩带一直延展到腰带。