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固原市疾病预防控制中心是在原固原市卫生防疫站（始建于1969年11月）的基础上于2003年5月组建成立，对外加挂“固原市艾滋病性病防治监测中心”、“固原市地方病防治中心”两块牌子，附设传染病防治综合门诊。中心具体实施政府对疾病预防控制以及卫生监督执法技术支撑职能，是固原市疾病预防与控制、应急预警与处理、疫情收集与报告、监测检验与评价、健康教育与促进、应用研究与指导、技术管理与服务的业务技术指导中心，也是固原市继续医学教育基地。