【摘 要】
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蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用,蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式.由于实验方法耗时耗力,因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义.首先对
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(60761001)
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蛋白质相互作用在生命活动中起着核心作用,蛋白质复合体亚基的结合是蛋白质相互作用的一种重要形式.由于实验方法耗时耗力,因此从理论上预测蛋白质相互作用有着特殊的意义.首先对蛋白质复合体的结合区统计其二级结构、超二级结构和二级结构组合的频数,以及这些结构占整个蛋白质氨基酸链中各类统计数目的百分比,得到各类型结构出现在结合区的相对倾向值.而后,根据相对倾向值给出相结合的两个蛋白亚基的氨基酸链的打分规则.选取64个氨基酸长度为标准滑动窗口,以1为步长,将每一对蛋白链得到一组分值作为特征值输入支持向量机,构建模型.用
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