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稻瘟病是导致粮食减产的重要病害之一.开发抗稻瘟病基因Pi1的分子标记并用于抗病分子育种是防治稻瘟病危害的有效途径.本研究根据Pi1与Piks 、Pikh、Pikm、Pikp、Pik、Pi7基因序列之间的SNP开发了荧光分子标记MM-Pi1,并利用其对94份水稻亲本材料进行检测,结果发现'安丰B'与'96B'中含有Pi1基因,52份水稻亲本含有与Pi1间具1个碱基差异的等位基因,40份水稻亲本中该等位基因缺失.对其中的10份水稻亲本材料的等位基因进行测序分析,进一步验证了分子标记检测结果的准确性.稻瘟病抗性鉴定试验结果表明,包含Pi1基因的'安丰B'与'96B'均对稻瘟病有高抗性.因此,Pi1荧光分子标记为水稻抗稻瘟病分子育种提供了新的基因分型方法.