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吐哈盆地侏罗系是一个盆地充填层序（一级层序），包括4个构造层序（二级层序），分别与侏罗纪湖盆的４个演化阶段（稳定沉降阶段、短期收缩阶段、扩张阶段和萎缩阶段）相对应，其中又分为13个（三级）层序。与海相地层不同的是，本区识别出了4种层序边界类型（A型、B型、C型和D型），其对应的层序本文分别称之为冲积层序、淹没层序、类Ⅰ型层序和Ⅱ型层序。冲积层序形成于构造剧烈抬升时的盆地萎缩阶段，淹没层序形成于构造沉降迅速时的盆地扩张阶段.