平榛AGAMOUS基因的克隆与生物信息学分析

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以野生平榛(Corylus heterophylla Fischer)为试材,采用RT-PCR方法从花芽中获得了一个平榛AGAMOUS基因cDNA,命名为ChAG,GenBank登录号为JN828811。序列分析结果表明,ChAG基因编码一个长度为726 bp,编码241个氨基酸的开放阅读框。氨基酸序列分析显示,该基因属于MADS家族AG亚家族。序列比对和系统进化分析表明,ChAG基因与欧榛的亲缘关系最近,相似性达99%。采用生物信息学手段对ChAG基因的保守结构域、疏水性和二级结构等进行分析。
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