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目的 分析广东地区2009年至2011年新型甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒神经氨酸酶(NA)基因变异及其耐药状况.方法 采用时空抽样方法,检测广东地区新型甲型H1N1流感病毒NA基因核苷酸序列；比对NA基因核苷酸序列,比较糖基化位点变异,构建马尔可夫链蒙特卡洛模拟进化树(MCMC进化树)；同时分析2009年至2011年广东地区新型甲型H1N1流感病毒株NA基因对NA抑制剂类药物奥司他韦和扎那米韦的耐药现状；计算50％抑制浓度(IC50),并对两种药物分别进行年份病毒株单因素方差分析(one-way ANOVA).结果 2009年至2011年67株病毒株NA基因出现N44S/K、R257K、I365T、N369K、N386S、I389M和I436V变异,2011年病毒株进化树主要分为两主干；2010年至2011年广东地区和其他地区的病毒株发生N44S变异,增加1个糖基化位点NQS42-44；2010年至2011年广东地区病毒株发生N386S变异,减少1个糖基化位点NFS386-388.广东地区病毒株对奥司他韦和扎那米韦均敏感,但出现3个离散值.结论 广东地区新型甲型H1N1流感病毒NA基因变异具有地区特征；糖基化位点变异对于病毒株致病性和抗原性的影响,有待于进一步研究；病毒株对NA抑制剂敏感,但应警惕出现耐药株。