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本文阐述了涉农科技企业经济核算上面临的难点及构建核算新模式的创新思路。探讨了农业科技企业经济核算创新方式。提出了农业科技企业经济核算应适应市场，以农业种业为主的股份有限公司的核算模式；中小种子企业的核算模式；家庭农场的核算模式；货币资金支付新模式；先进的计算机技术和财务管理信息模式等建立依创新为目标效益的系列操作。