荸荠CCoA OMT基因的克隆与表达分析

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咖啡酰辅酶-A-O-甲基转移酶(CCoAOMT)是植物木质素合成的关键酶之一.为探明CCoA OMT在荸荠木质素单体合成过程中的作用,本研究利用RACE技术在荸荠球茎中克隆CCoA OMT基因的全长序列,并对其在不同组织和鲜切荸荠贮藏过程中的表达进行分析.结果 表明,克隆得到荸荠CCoA OMT基因cDNA全长1 302 bp,将此基因命名为CwCCoA OMT,其GenBank登录号为MG719240.该序列包含一个786 bp的最大开放阅读框,可编码261个氨基酸,其DNA中包含4个内含子和5个外显子.该蛋白的分子量为29.17kD,理论等点为5.21.CCoAOMT蛋白二级结构中α-螺旋占37.55%,无规则卷曲占35.63%,延伸链占19.16%,β-折叠结构占7.66%.序列比对和系统进化树分析表明,CwCCoAOMT蛋白与其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度较高,其中与慈竹的亲缘关系最近.通过各组织表达特性分析发现,CwCCoA OMT在荸荠皮中的表达最高,在荸荠肉中的表达最低.在鲜切荸荠贮藏过程中CwCCoA OMT的表达呈快速上升趋势,而水杨酸处理能显著抑制CwCCoA OMT表达上升.本实验结果可为控制鲜切荸荠黄化的研究提供理论依据.
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