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[目的]了解济宁市HIV-1毒株亚型变异情况。[方法]应用套式-PCR方法对2例HIV-1感染者的外周血单核细胞样本进行扩增，对C2-V3区核苷酸序列进行测定和分析。[结果]所采样本均属HIV-1 B亚型，与其他国际亚型的基因离散率在15％以上，与流行于云南省的B亚型毒株基因离散率为3.49％。[结论]流行于济宁市的HIV-1毒株属B亚型，与云南省流行株密切相关，流行时间约3～4年。