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肠道病毒71型VP1外壳蛋白二级结构及B细胞表位预测

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：purong0826
【摘 要】
：
目的预测肠道病毒71型（EV71）外壳蛋白VP1二级结构和B细胞表位，为制备EV71疫苗的研究提供理论基础。方法应用GOR4、HNN、SOPMA、nnPredict等方法预测EV71 VP1二级结构，并结合亲水
【作 者】
：
蒋建平 王来 李宜川 高明灿 
【机 构】
：
商丘医学高等专科学校基础医学部
【出 处】
：
山东医药
【发表日期】
：
2009年35期
【关键词】
：
手足口病 肠道病毒VP1 二级结构 B细胞表位 hand-foot-mouth disease  enterovirus type 71 viral prote 
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目的预测肠道病毒71型（EV71）外壳蛋白VP1二级结构和B细胞表位，为制备EV71疫苗的研究提供理论基础。方法应用GOR4、HNN、SOPMA、nnPredict等方法预测EV71 VP1二级结构，并结合亲水性、柔韧性、表面可能性和吴氏抗原指数法综合预测潜在的B细胞表位。结果EV71 VP1二级结构以无规卷曲和β-片层为主，含有少量的α-螺旋，少见β-转角；EV71 VP1潜在的B细胞表位很可能位于第67-71位氨基酸残基。结论联合多种生物信息学方法成功预测了EV71 VP1二级结构和B细胞表位；此为制
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