传染性支气管炎病毒山东分离株S1基因的克隆及序列比较分析

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参照Genbank中传染性支气管炎病毒(IBC)M41纤突蛋白S1的基因序列,设计一对引物,对山东地区IBV分离株RNA进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCB),成功扩增出约1634bp S1基因片段.将扩增出的S1基因分别克隆到TEasy质粒载体中,获得重组质粒,提取质粒DNA,利用ECo.RI酶切证实了重组质粒的特异性,并进行序列测序.克隆出的序列已被GeneBank收录,序列号为:AY043313.将得到的序列与标准株M41进行核酸序列和氨基酸同源性比较分析,与M41的核苷酸同源率99%.利用Omigo 2.0软件对克隆出的山东IBV进行了理论酶切位点分析,在BstYI、AluI和BgⅢ位点与M41不同.结合血清学和分子生物学实验结果推测:山东A分离株可能是M41的变异株.
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