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基于《2011年中国高技术产业统计年鉴》数据，利用DEA基本模型，对我国25个省、市、自治区2007—2010年的创新活动效率进行评价，结果表明：全国各省市区创新活动的效率普遍不高，DEA有效省市区只有5个；20个DEA无效省市区中大约有50％存在投入冗余现象，有60％存在产出不足。为提高我国省际创新活动的效率，缩小地区间创新效率的差异，应强化政府引导作用，完善R＆D人才激励机制，加强地区间的R＆D合作，提高企业自主创新能力。