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医院的性质决定医院会计科目的设置，在实际工作中，两种会计制度规定的会计科目各有其优缺点。随着医药卫生体制改革的深入发展，新《医院财务制度》、《医院会计制度》于2012年在全国范围内实施，现行医院会计制度有了很多改进，对体现我国医院的公益性质及提升我国医院效率效益起到了十分重要的作用。本文试就两种科目之间的关系及比较进行讨论，并提出了解决医院资产虚增问题的思路，从而进一步完善医院会计科目的设置。