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过氧化物酶体增生激活型受体与动脉粥样硬化关系密切，过氧化物酶体增生激活型受体α和γ表达增加均可抑制循环中白细胞粘附到血管内皮上，减少炎症介质的产生，抑制血管平滑肌细胞迁移。过氧化物酶体增生激活型受体α表达增加还能使循环中高密度脂蛋白浓度增加，产生抗动脉粥样硬化作用；而过氧化物酶体增生激活型受体γ激活则产生致动脉粥样硬化作用。