论文部分内容阅读
目的
探讨piRNA在肝细胞肝癌发生、发展中的作用。
方法对肝癌患者的癌及癌旁组织、转移及非转移的肝癌组织进行小RNA二代测序,将测序数据过滤掉常见RNA序列后去重复;用piRNA预测器预测可能的新piRNA,并和下载的已知piRNA合并,筛选得到差异明显的piRNA。以miranda算法预测相应靶基因,并对其进行富集分析和功能预测,并选取piRNA在LM3和PLC细胞中行进一步功能(迁移能力)实验及分析。两组间均数比较采用独立样本t检验。
结果测序共获得66 772个piRNA(已知149个),发现癌和癌旁组织表达差异明显的有241个piRNAs,转移和非转移肿瘤组织表达差异明显的1 634个piRNAs。对差异piRNA的靶基因进行GO和KEGG通路分析,发现主要和细胞黏附相关。而对选取的一个piRNA(piR1/97)进行功能实验,显示其促进肝癌细胞的迁移(LM3:t = 8.829,P < 0.05;PLC: t = 7.318,P < 0.05)。
结论piRNA在肝细胞肝癌患者的癌及癌旁组织、转移及非转移患者的肝癌组织中表达量有差异,并可能参与肝细胞肝癌的转移过程,更多的功能分析需要进一步研究和实验确证。