荧光交换标记法基因表达芯片的数据挖掘

来源 :福建医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:khsim
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目的探讨荧光染料交换标记设计的基因芯片数据挖掘方法,并对低剂量电离辐射影响人成纤维细胞基因表达谱数据进行分析。方法应用GeneSifter在线软件和Panther生物学信息数据库,对下载于NCBI的GEO数据库的8个样品GSM(包含4个时间点),选择正确的参数设置上载数据,运用ANOVA方法进行数据挖掘,并对差异表达基因进行功能归类分析。结果获得203条差异表达基因,合并相同基因名后为176条基因。双向聚类和主成分分析发现,样品的24h时间点基因表达谱与前3个时间点有显著差异,功能归类分析提示,多个生物通
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