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通过建立随机基因组文库和序列测序，对日本囊对虾基因组进行了较大规模的微卫星分布特征分析．在1606711bp的随机基因组序列中，共找到1206个微卫星序列，其序列总长度约占测序序列总长度的5．9％．微卫星序列中，以两核苷酸重复的序列数目最多，约占微卫星总数的69．82％，三核苷酸重复次之，约占12．35％．两核苷酸重复中以AT重复最为丰富，约占两核苷酸重复序列总数的29．44％．微卫星在低拷贝区间（≤42）数量相对较大，约占比例为72．31％．重复单位拷贝数的变异能力分析表明，变异系数最大的前3种重复类型