【摘 要】
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基于南海北部陆坡不同深度梯度3个站位表层沉积物古菌氨单加氧酶基因(amoA)文库,对3个站位氨氧化古菌进行多样性和系统发育学分析.多种方法构建的系统发育树表明:3个站位所有的amoA基因序列都隶属于奇古菌门中Group Ⅰ分枝内的Group Ⅰ.1a系群,且各站位之间氨氧化古菌多样性没有明显的差异.501站位黑色砂质沉积物中古菌amoA基因与该站位的16S rRNA基因的系统发育比对显示:这2种基
【机 构】
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中国科学院边缘海地质重点实验室,中国科学院南海海洋研究所,广州510301;中国科学院大学,北京100049
【出 处】
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中国第四纪科学研究会珊瑚礁专业委员会2016年度学术会议
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基于南海北部陆坡不同深度梯度3个站位表层沉积物古菌氨单加氧酶基因(amoA)文库,对3个站位氨氧化古菌进行多样性和系统发育学分析.多种方法构建的系统发育树表明:3个站位所有的amoA基因序列都隶属于奇古菌门中Group Ⅰ分枝内的Group Ⅰ.1a系群,且各站位之间氨氧化古菌多样性没有明显的差异.501站位黑色砂质沉积物中古菌amoA基因与该站位的16S rRNA基因的系统发育比对显示:这2种基因标记的系统发育树整体上具有潜在的对应关系,说明对样品的氨氧化古菌多样性分析比较全面且可靠;并进一步暗示该样晶中氨的硝化作用主要由奇古菌门下的Group Ⅰ.1a系群来执行.由此可以推测:Group Ⅰ.1a系群可能在南海北部表层沉积物中氮素的生物地球化学循环过程中扮演重要的角色.
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