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华中农业大学资源与环境学院的前身是建于1948年的武汉大学农业化学系。1952年，武汉大学农学院、湖北农学院和湖南农学院有关系科合并组建华中农学院土壤农化系。1994年，土壤农化系微生物学科专业整体划入新成立的生命科学技术学院。1997年，土壤农化系更名为资源环境与农业化学系。2002年，以该系为基础组建了资源与环境学院。