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三峡库区是我国重点敏感生态区和长江中下游的生态屏障，其生态环境质量直接关系到三峡工程的综合效益和长江中下游的生态安全。在分析三峡库区生态环境现状与主要生态环境问题、明确生态环境敏感性和生态服务功能重要性空间分异基础上，综合采用GIS分析、聚类分析和专家集成等方法，根据生态功能区划的原则，按三级分区的等级体系将三峡库区划分为4个自然生态区、6个生态亚区、9个生态功能区；并探讨了各生态功能区主要的生态环境问题、功能定位及生态环境建设措施与重点，以期为三峡库区生态环境保护与建设规划提供依据。