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目的 探究不同分子生物学方法检测手足口病标本的效果。方法 选取我院收集的120份手足口病标本,分别根据不同分子生物学方法,将其分为实时RT-PCRZ组、一步法RT-PCRZ组、巢式PCR组进行检测,比较分析三种方法检测肠道病毒71型（EV71）敏感性。结果 实时RT-PCR法与巢式PCR手足口病检测率明显高于与一步法RT-PCR法（P〈0.05）。结论 在手足口病检测方面,实时RT-PCR法与巢式PCR法具有较高的检测准确性,值得在临床检测中推广。