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昆虫种类丰富，数量庞大，与人类生活关系密切，在农业生产中已经成为不可忽视的一部分。基因组学测序技术的迅速发展大大促进了昆虫功能基因学。本文综述了农业昆虫功能基因组学在生长发育、多型现象、抗药性、化学信号感受机制、代谢组学以及肠道微生物等方面的最新研究进展，并对农业昆虫在未来研究中新思路和新技术的应用做出了展望。