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目的：对登革病毒2型海南分离株NS1全序列进行测定和生物信息学分析,了解其系统进化和分子流行病学特征。方法：采用RT-PCR法扩增D2-Hainan全长NS1基因,将其克隆入载体pPIcZαB,测序,采用相关软件进行生物信息学分析。结果：获得D2-Hainan株NS1全长基因1056bp,其序列与登革病毒2型NGC株的同源性为95%。系统进化树分析显示该毒株与登革病毒2型China04株的亲缘关系最近。初步分析了NS1蛋白的氨基酸序列特征和二级结构。结论：登革病毒流行株存在地域性和复杂性,对D2-Hain