金铁锁WRKY转录因子基因鉴定及其蛋白序列特征和功能特性分析

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目的鉴定金铁锁WRKY(PtWRKY)转录因子基因,并分析其蛋白序列特征和功能特性。方法采用生物信息学方法,对具有全长开放阅读框(ORF)的PtWRKY转录因子基因进行鉴定,并对其蛋白理化特征、基序(motif)和保守结构域、系统进化、转录因子结合位点信息及表达模式进行分析。结果于金铁锁转录因子数据库中鉴定出10个具有完整ORF的PtWRKY家族基因,蛋白长度为203~371 aa,分子量为23.0~43.1 kD,均具有WRKYGQK保守结构域。系统聚类分析将10个PtWRKY蛋白、9个人参WRKY蛋白
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