【摘 要】
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目的 分析南宁市2019年H3N2流感病毒流行情况及血凝素(HA)基因和神经氨酸酶基因(NA)分子特征,及时掌握本地流感病毒流行动态和进化方向,为流感治疗及疫苗株的筛选提供科学依
【机 构】
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南宁市疾病预防控制中心,广西南宁530023
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目的 分析南宁市2019年H3N2流感病毒流行情况及血凝素(HA)基因和神经氨酸酶基因(NA)分子特征,及时掌握本地流感病毒流行动态和进化方向,为流感治疗及疫苗株的筛选提供科学依据. 方法 从全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)数据库获得2019年南宁市H3N2 HA和NA全长核苷酸序列.用MEGA V7.0和Interactive Tree of Life V5 (iTOL V5)软件构建系统发育树,利用NetN Glyc1.0软件预测HA、NA基因糖基化位点,用DNAstarV8.1.3软件对流感病毒的HA和NA同源性、氨基酸变异情况进行分析. 结果 14株流感病毒的HA和NA基因在系统发育树上均聚成4个类群,进化分类基本一致.本地毒株HA、NA基因与2019-2020年疫苗毒株A/Kansas/14/2017同源性较低.与A/Kansas/14/2017相比,14个毒株HA基因449位点发生突变,导致糖基化位点的减少,1个毒株在142位点增加一个糖基化位点;NA基因无糖基化位点的变化.相对于A/Kansas/14/2017,南宁毒株HA1区蛋白分子上有6(135、137、144、159、160和190)个的氨基酸发生了替换,且涉及到2～3个抗原决定簇位点;受体结合位点突变主要集中在2个位点;NA基因有1个抗原位点整体发生突变,耐药位点非常保守. 结论 南宁市2019年H3N2亚型流感病毒在流行过程中相对2019-2020疫苗株发生了一定的变异,其匹配度低于2018-2019及2020-2021年疫苗毒株,尤其是HA的变异可能导致疫苗对本地区人群保护作用降低,导致流感流行.
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