【摘 要】
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目的 了解中山市2018年呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus,RSV)流行株序列特点分析;为分析类似疫情中所检出的RSV进行快速分型和溯源提供依据.方法 使用基因扩增和生物信息学分析方法,对2018年流感样病例监测样及一起社区聚集性流感样疫情样本的RSV阳性病毒进行亚型分型和G基因高变区序列特征分析.结果 在1025例流感样病例的标本共检出60份RSV核酸阳性,RSV阳性率为5.8％;经过PCR和毛细管凝胶电泳分析,获得的6例标本和1例疫情标本中RSV的基因分型均为RS
【机 构】
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中山市疾病预防控制中心病原微生物与生物检验所,广东528400
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目的 了解中山市2018年呼吸道合胞病毒(Respiratory Syncytial Virus,RSV)流行株序列特点分析;为分析类似疫情中所检出的RSV进行快速分型和溯源提供依据.方法 使用基因扩增和生物信息学分析方法,对2018年流感样病例监测样及一起社区聚集性流感样疫情样本的RSV阳性病毒进行亚型分型和G基因高变区序列特征分析.结果 在1025例流感样病例的标本共检出60份RSV核酸阳性,RSV阳性率为5.8％;经过PCR和毛细管凝胶电泳分析,获得的6例标本和1例疫情标本中RSV的基因分型均为RSV A亚型;7例RSV阳性标本的G蛋白基因扩增成功并且测序成功(ZS2018RSV01-07,Genbank MW455129-MW455135);与监测样本相比,疫情标本在高变区T264A,S313F,T319K等位点存在特异性氨基酸位点突变.结论 本研究获得的中山市2018年RSV的流行株为A亚型中ON1基因型,3月份社区聚集性肺炎中获得的疫情分离株RSV中G基因高变区的位点突变可能有助于改变宿主细胞对病毒的识别能力以及病毒逃避宿主的免疫反应,从而可能更加有助于RSV的爆发流行,建议加强对RSV的监测.
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