滁州地区2例H9亚型禽流感病例病原HA基因的克隆与序列分析

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采集滁州地区5县市范围内11例疑似流感病鸡的气管和肺脏组织,参照GenBank已经发表的禽流感病毒H9N2的HA基因序列,采用RT-PCR技术成功的扩增出2例流感病毒HA基因的完整读码框,分别命名为AH1、AH2,并进行序列测定及分析.序列分析显示:AH1、AH2 HA基因全长都为1 683 nt,二者基因的同源性为98.9%,只有10个核苷酸存在差异.AH1、 AH2 HA基因与GenBank登陆的鸡源禽流感病毒H9N2HA基因的同源性在90%~97%之间.AH1和AH2两株裂解位点均为RSSR ↓ GLF,具有典型的低致病性禽流感病毒的特征,未发生太多突变.
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