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加强党的建设是推进现代农业科研院所建设的重要保证。进入新时代,在实施创新驱动战略和乡村振兴战略的背景下,加强农业科研单位党的建设面临新的形势与任务。文章回顾了院所长负责制下的农业科研单位基层党组织地位与作用的演变过程,阐述了发挥基层党组织战斗堡垒作用的路径,并提出了落实主体责任、加强队伍建设、融入中心工作、注重基层党建创新、加强制度建设等促进农业科研单位基层党组织发挥战斗堡垒作用的对策。