目的 分析2006年北京地区流行的3、7和11型腺病毒(ADV)的部分六邻体基因序列,了解该地区ADV流行型别及六邻体基因变异情况.方法 采集急性呼吸道感染患儿咽拭子或鼻咽分泌物标本,分离病毒及免疫荧光快速抗原检测.对抗原检测和/或病毒分离为ADV阳性的61份标本进行PCR分型检测.随机选取分离到的3株ADV3,3株ADV7和3株ADV11毒株,扩增其六邻体近5′端1278 bp基因片段进行序列分析并与GenBank发表的部分序列进行比较和进化树分析. 结果 61份ADV检测为阳性的标本中,ADV3占60.73%(37/61);ADV7占27.9%(17/61);ADV3和ADV7混合感染占1.6%(1/61);ADV11占4.9%(3/61);非3、7、11和21型4.9%(3/61);未检测到21型ADV.3株.ADV3分离株与2005年广州分离株(AY878716)亲缘关系最近,与其他株比较,3株北京分离株氨基酸的变异位点主要有3个.3株ADV7分离株与1998年日本分离株(AF053086)的亲缘关系最近.与其他株比较,3株北京分离株氨基酸的变异位点主要有1个.3株ADV11分离株与2004年H本分离株(AB162772)的亲缘关系最近(100%),但是这4株(包括日本的毒株)与其他毒株比较其氨基酸的变异位点有12个.相对于3型和7型,11型ADV的变异最大,表现为变异的氨基酸位点的分布较为分散,其次是3型ADV,而7型ADV的变异较小. 结论 2006年北京地区引起婴幼儿急性呼吸道感染的ADV以3型为主,7型为辅,11型较为少见,未发现21型;3、7和11型ADV北京分离株与GenBank中其他序列比较虽然有着较高的同源性,但是还都有一定的核苷酸和氨基酸的变异;变异多发生在抗原决定簇密集的HVR1区和HVR7区。
北京地区2006年流行的3、7和11型腺病毒部分六邻体基因序列分析
【摘 要】
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目的 分析2006年北京地区流行的3、7和11型腺病毒(ADV)的部分六邻体基因序列,了解该地区ADV流行型别及六邻体基因变异情况.方法 采集急性呼吸道感染患儿咽拭子或鼻咽分泌物标本,分离病毒及免疫荧光快速抗原检测.对抗原检测和/或病毒分离为ADV阳性的61份标本进行PCR分型检测.随机选取分离到的3株ADV3,3株ADV7和3株ADV11毒株,扩增其六邻体近5′端1278 bp基因片段进行序列分
【机 构】
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100020,首都儿科研究所病毒研究室北京市感染与免疫中心实验室,100020,首都儿科研究所病毒研究室北京市感染与免疫中心实验室,100020,首都儿科研究所病毒研究室北京市感染与免疫中心实验室,1
【出 处】
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中华流行病学杂志
【发表日期】
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2008年29期
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