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菌群与人类健康和疾病密切相关，新生儿菌群受许多因素的影响。本文主要概述了本课题组在菌群与新生儿疾病关系方面的初步探索：新生儿呼吸机相关性肺炎致病菌以群体形式即生物膜形式致病；新生儿口咽部常寄居的链球菌通过自身诱导因子-2起辅助致病菌作用；新生儿坏死性小肠结肠炎肠壁及粪便中变形菌门相对丰度升高而厚壁菌门相对丰度降低，与短链脂肪酸合成不足进而调节性T细胞分化不足有关；新生儿早发败血症时经验性使用抗生素1周可明显降低肠道菌群多样性，易于损伤肠道自然防御屏障；剖宫产儿肠道拟杆菌属含量明显不足，健康平衡的肠道菌群迟迟不能建立。