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医疗纠纷的鉴定主要有两种方式,一是人们较熟悉的医学会鉴定专家组进行的医疗事故鉴定,一种是通过司法鉴定部门进行的因果关系鉴定,即司法鉴定。司法鉴定是指在诉讼过程中,为查明案件事实,人民法院依据职权,或者应当事人及其他诉讼参与人的申请,指派或委托具有专门知识的人,对专门性问题进行检验、鉴别和评定的活动。两者在启动程序、鉴定人员等方面均有不同。