【摘 要】
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运用计算机辅助药物设计寻找红毛七抗炎生物碱类活性成分.以“红毛七”为关键词,在TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构;再从蛋白质数据库中下载与抗炎作用明确的7个靶点蛋白,采用Sybyl软件中蛋白质预处理工具确定活性区域,应用Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score打分函数筛选出活性成分,采用Discovery Studio、Pymol软件分析结合最好的蛋白复合体的相互作用力.筛选出具有较好结合活性的化合物9个,其中Cau
【机 构】
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武汉职业技术学院 生物工程学院,湖北 武汉 430074
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运用计算机辅助药物设计寻找红毛七抗炎生物碱类活性成分.以“红毛七”为关键词,在TCMSP数据库中搜索生物碱类化学成分,从Pubchem数据库下载相应化合物结构;再从蛋白质数据库中下载与抗炎作用明确的7个靶点蛋白,采用Sybyl软件中蛋白质预处理工具确定活性区域,应用Surflex-dock模块对小分子与靶蛋白进行分子对接,通过Total Score打分函数筛选出活性成分,采用Discovery Studio、Pymol软件分析结合最好的蛋白复合体的相互作用力.筛选出具有较好结合活性的化合物9个,其中Caulophyllumine A、(+)-reticuline、Magnolamide、caulophylline A、caulophylline B具有多靶标活性;蛋白复合体的分析结果显示氢键、疏水作用力在对接中发挥着重要作用.为中药红毛七抗炎活性成分的研究提供了参考,也为中药多靶点作用的研究提供了理论依据.
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