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微生物-肠-脑轴（microbiota-gut-brain axis, MGBA）是动物机体最主要的生理代谢调节机制之一。肠道菌群在肠道与大脑通过神经和内分泌等物质介导的双向应答系统中发挥着关键作用。目前，MGBA在畜禽营养代谢方面的研究已有不少报道，但在畜禽生产应用和功能性疾病方面研究较少。本文从微生物及其代谢物与宿主肠道、神经内分泌系统、免疫系统之间的联系入手，综述了畜禽MGBA调节机制的研究进展，以期为畜禽MGBA的研究应用提供新思路，达到科学高效养殖的目的，从而提高畜禽经济效益与动物福利，促进畜禽养殖业高效健康发展。