新常态经济背景下探究长江经济带高等教育、科技创新和经济增长的耦合协调关系，不仅有助于推动我国经济增长方式的转变还能促进区域共同发展。本研究选取2007—2018年长江经济带城市群高等教育、科技创新和经济增长24个指标并通过耦合度模型、σ收敛性检验以及分位数回归模型探究长江经济带城市群三大系统的耦合协调效应及差异影响因素。研究发现：2007—2018年长江经济带城市群三大系统综合发展水平整体呈现稳步上升趋势；长江经济带城市群三大系统的耦合协调关系表现为增长型和同步型；2007—2018年长江经济带城市群耦合协调呈现稳步上升趋势，由轻度失调逐渐转化为初级协调且耦合协调度σ值呈现阶段性σ收敛，不同城市群的耦合协调存在显著差异；各省市的耦合协调水平呈现出“由东北向西南逐渐递减”的空间异质性。从影响因素看，专任教师、科研人员、科技成果转化和居民消费水平在0.1至0.9分位点上对长江经济带城市群的耦合协调效应产生显著影响。