【摘 要】
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利用甲基化CG位点建立并验证肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）预后相关模型是当前的研究热点。利用R语言平台分析肝癌基因组图谱数据库（TCGA-LIHC）和基因表达综合数据库（GSE136380）甲基化组学数据，采用limma包分析TCGA-LIHC和GSE136380数据差异甲基化CG位点，采用wgcna包对GSE136380进行加权基因共表达网络分析，确定三者交
【基金项目】
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山西省应用基础研究计划项目（201901D211480）；
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利用甲基化CG位点建立并验证肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）预后相关模型是当前的研究热点。利用R语言平台分析肝癌基因组图谱数据库（TCGA-LIHC）和基因表达综合数据库（GSE136380）甲基化组学数据，采用limma包分析TCGA-LIHC和GSE136380数据差异甲基化CG位点，采用wgcna包对GSE136380进行加权基因共表达网络分析，确定三者交集为关键甲基化CG位点集，共获得83个甲基化CG位点。利用LASSO-COX风险比例回归分析筛选出6个甲基化CG位点，包括cg15744128、cg24282479、cg17922226、cg13090969、cg23505966和cg08708079，构建并验证HCC外科切除术后的预后模型。拟合模型在训练集中1、3和5年的AUC分别是0.756（95%CI:0.644～0.876）、0.749（95%CI:0.638～0.854）和0.797（95%CI:0.661～0.920）；测试集中1、3和5年的AUC分别为0.848（95%CI:0.680～0.990）、0.833（95%CI:0.697～0.974）和0.685（95%CI:0.553～0.903）。Kaplan-Meier曲线展示出模型能精准鉴别出HCC切除术后的预后差的高危患者（logrank检验P＜0.001）和易复发患者（logrank检验P＜0.001），研究结果有助于进一步制定治疗方案使患者受益。
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